Основной элемент народных сказок // Библиотека для Чтения, 1863
Русская женщина в допетровской России // Модный Магазин, 1863
Материалы для изучения народной словесности. СПб., 1863
Русская книжка. СПб., 1863
Рассказы о старинных людях. Вып. 1—4. СПб., изд. Бакста, 1864—65
По поводу двух выпусков песен Киреевского // Московские Ведомости, 1864
Самоучитель для начинающих обучаться грамоте, СПб, 1865 (изд. запрещено)
Слово св. Игнатия для истинных христиан. Женева, 1865
Рассказы о великих людях средних и новых времен, СПб., изд. Гайдебурова, 1866
Древняя Русь. СПб., 1867
Жизнь природы и человека, 1867
Опыт автобиографии. Женева, 1882
Верхоянский сборник // Записки Вост.-Сиб. отд. Русского Географического общества по этнографии. Т. 1. Вып. 3. Иркутск, 1890
Образцы народной литературы якутов. Вып.1-2. Пб., 1913—1918
Записки каракозовца, М. — Л., 1930
Великорусские сказки в записях И. А. Худякова. М.; Л., Наука, 1964
Краткое описание Верхоянского округа, Л., Наука, 1969
Работы этого автора, опубликованные до 1 января 1945 года, находятся в общественном достоянии в России. Работы этого автора, опубликованные сто и более лет назад, находятся в общественном достоянии во всём мире, поскольку он умер более 100 лет назад.
Биография в 
